Différents outils d’évaluation de la qualité des eaux se sont succédés depuis les années 70, et ce pour les différents éléments de qualité qui ont été suivis dans le cadre des réseaux de mesure :
 la qualité physico-chimique évaluée selon la grille d’évaluation de 1971 (lien vers la carte de qualité selon la grille de 1971) puis selon le système d’évaluation de la qualité des eaux (SEQ-Eau (lien vers la carte de qualité selon le SEQ-Eau)),
 la qualité biologique évaluée grâce à des indicateurs relatifs aux peuplements de végétaux (Indice Biologique Diatomées ou IBD), d’invertébrés (Indice Biologique Global Normalisé ou IBGN) et de poissons (Indice Poisson Rivière ou IPR),
 la qualité hydromorphologique des cours d’eau évaluée selon le Système d’Evaluation de la Qualité Physique (SEQ-Physique).

La Directive Cadre sur l’Eau (DCE) introduit désormais la notion d’évaluation de l’ « état » des eaux, à distinguer de l’évaluation de la « qualité » des eaux.

L’état est défini comme étant la situation la plus déclassante entre un état chimique (lien vers les cartes d’état chimique) se rapportant à des normes de concentration de certaines substances particulièrement dangereuses (toxiques), et un état écologique (lien vers les cartes d’état écologique) qui repose sur une évaluation des éléments de qualité physico-chimiques et biologiques.

Pour plus d’informations, les annuaires de qualité présentent le détail des méthodologies suivies en matière d’évaluation de la qualité et de l’état des eaux. Ils apportent également un diagnostic complet, via des tableaux, graphiques et commentaires, de l’état des milieux aquatiques du bassin Artois-Picardie.