Le milieu physique de la Trie est moyennement perturbé d’une part en raison d’anciens travaux de curage et de rectification, et d’autre part par la présence de voieries longeant le lit mineur sur un important linéaire.
Le lit mineur est sérieusement perturbé car il cumule des altérations liées à son déplacement et à une importante sédimentation du substrat. Au total 9 ouvrages dont 2 infranchissables sont présents dans le lit mineur. Seul le tronçon 1 échappe en partie à cette situation.