Thèse réalisée par Karine AUTREAUX-NOPPE, UFR de Biologie, Université des Sciences et Technologies de Lille, 2000.
Un premier bilan des compositions floristiques et des pratiques de suivi en matière de phytoplancton dans les cours d’eau en Europe et dans le bassin Artois-Picardie a été réalisé. Il montre l’absence totale d’uniformisation des techniques d’échantillonnage et d’analyse. Pour une meilleure stratégie d’échantillonnage et une bonne interprétation des données, l’ampleur des variations aux petites échelles de temps et d’espace et l’importance de la variabilité analytique au niveau taxonomique et pigmentaire ont été étudiées. Ces variations montrent qu’il est au moins nécessaire de standardiser et, si possible, normaliser les méthodes de comptage et d’analyse de pigments. Par ailleurs, pour limiter l’évolution des pigments du transport à l’analyse, la filtration sur place n’est pas indispensable mais la conservation à 4 °C et à l’obscurité est nécessaire. La variabilité à micro-échelle et à petite échelle spatiale est faible et négligeable, indiquant qu’un prélèvement dans la zone d’écoulement maximal est représentatif du site de prélèvement. A l’inverse, la variabilité à petite échelle temporelle est élevée, montrant que pour obtenir une meilleure estimation du peuplement phytoplanctonique, il faut augmenter la fréquence d’échantillonnage.